Řeka San Juan vytéká z Jezera Nicaragua a kopíruje hranici s Kostarikou, aby se po téměř 200 km ztratila v Karibském moři. Návštěvu tohoto toku by si neměli nechat ujít ti, kteří mají rádi přírodu, divoce žijící zvířata, jako jsou například kajmani a také pozorování vodního ptactva. Lodě vyplouvají z městečka San Carlos, které se nachází při východním cípu Jezera Nicaragua, případně ze Sábalos, malého města na soutoku řek San Juan a Sábalos, odkud je možné navštívit rezervaci Río Indio-Maíz nebo španělskou pevnost El Castillo.
