První a nejstarší hlavní město Hondurasu bývalo také hlavním ústředím španělské koloniální vlády, odkud kontrolovala všechny provincie ve Střední Americe. Město bylo založeno v roce 1536 a sídlem vlády bylo pouze do roku 1549, ve kterém se přestěhovala do Antiguy v Guatemale. Vzpomínkou na léta slávy i pozdější roky zůstává několik pozoruhodných staveb, jako je například kostel Las Mercedes, katedrála San Marcos nebo kostel San Sebastián a hlavně španělská pevnost Castillo San Cristóbal. Gracias je také kulturním centrem lidu Lenca.
