Koloniální městečko Comayagua bylo založeno v roce 1537 a bývalo hlavním městem Hondurasu. V centru města se nachází Katedrála Comayagua a kostel La Merced, z dalších památek stojí za návštěvu kostely La Caridad, San Francisco a San Sebastian, rezidence biskupa a také budova Archeologického muzea, která sloužila jako prezidentský palác. V místní Katedrále se nacházejí nejstarší hodiny v Americe, pocházející z roku 1.100. Město je i významným náboženským centrem, v týdnu mezi Květnou a Velikonoční nedělí se v Comayague konají procesí a ulice zdobí nádherné barevné obrazce z písku a dalších přírodních materiálů.